Современные биологические очистные сооружения «Биосфера» обеспечили очистку сточных вод до 99,9% и перевели предприятие на практически замкнутый цикл водопотребления. Высокотехнологичный комплекс переработки нефти «Евро+» заменил 5 устаревших установок прошлого экологического поколения, которые были демонтированы. МНПЗ системно обновляет инфраструктуру хранения топлива. Благодаря строительству современных терминалов отгрузки продукции в автомобильный и железнодорожный транспорт повышена эффективность и экологичность процесса, увеличена надежность поставок топлива на столичный рынок.

МНПЗ первым в отрасли создал автоматизированную систему мониторинга воздуха и стал пилотной площадкой по внедрению подобных систем для остальных промышленных предприятий.

Московский НПЗ продолжает программу экологической открытости. С 2011 года промплощадку посетило более 4 тыс. экспертов, представителей общественных организаций и СМИ, учащихся школ и вузов, местных жителей.

Предприятие поддержало 85 городских экологических проектов. Приоритетными направлениями стали благоустройство, озеленение и развитие инфраструктуры. На территории Юго-Восточного округа столицы было высажено более 4,5 тыс. деревьев.

Активному внедрению нововведений способствовала модернизация, которую с 2011 года проводит «Газпром нефть». Благодаря выполненным проектам Московский НПЗ сократил воздействие на окружающую среду в 4 раза. Сегодня проводится третий заключительный этап, цель которого — довести глубину переработки нефти почти до 100%, полностью обновить производственные мощности и перейти на безотходное производство.